Binnen de Programmalijn Prefab wordt gekeken naar nieuwe bouwwijzen om bouwplaatsemissies bij woningbouw te reduceren. Om deze emissiereductie te kwantificeren wordt er bij het indienen van elk projectvoorstel gebruik gemaakt van de TNO bouwemissietool. Gedurende het programma kan met behulp van deze tool de voortgang eenvoudig worden bijgehouden. Er kan op gebied van emissies veel verbeterd worden zowel bij nieuwbouw als bij renovatie- of transformatie van bestaande bouw. Denk hierbij aan prefab nieuwbouwwoningen of het optoppen van bestaande gebouwen. Toepassing van nieuwe of verbeterde materialen kan de emissiereductie verder ondersteunen. In deze programmalijn wordt het effect van procesmaatregelen op emissiereductie onderzocht.

De programmalijn Prefab richt zich naast emissiereductie, ook op industrialisatie en het optimaliseren van de bouwlogistiek. Het doel hiervan is om projecten met een groot marktpotentieel op te schalen, waardoor zowel een versnelling van de woningbouw als emissiereductie kan worden bewerkstelligd.